| タイトル | DNA sequence analysis Plutella xylostella granulovirus |
| その他のタイトル | Plutella xylostella granulovirusのDNAシーケンス解析 |
| 著者（日） | 橋本 義文; 藤田 知範; 上野 泰正 |
| 著者（英） | Hashimoto, Yoshifumi; Fujita, Tomonori; Ueno, Yasumasa |
| 著者所属（日） | 京都工芸繊維大学 繊維学部 応用生物学科; 京都工芸繊維大学 繊維学部 応用生物学科; 京都工芸繊維大学 繊維学部 応用生物学科 |
| 著者所属（英） | Kyoto Institute of Technology Department of Applied Biology, Faculty of Textile Science; Kyoto Institute of Technology Department of Applied Biology, Faculty of Textile Science; Kyoto Institute of Technology Department of Applied Biology, Faculty of Textile Science |
| 発行日 | 1999-06 |
| 発行機関など | Institute of Physical and Chemical Research |
| 刊行物名 | RIKEN Review
RIKEN Review |
| 号 | 22 |
| 開始ページ | 30 |
| 終了ページ | 33 |
| 刊行年月日 | 1999-06 |
| 言語 | eng |
| 抄録 | A Plutella xylostella Granulovirus (PxGV) was used for the determination of the entire nucleotide sequence of the virus genome. The size of the PxGV genome was 100,999 base pairs (bp). One hundred and twenty ORF (Open Reading Frame) of 50 amino acids or more were found. Among these ORF, 57 ORF were common to the five baculoviruses. Gene parity plot analysis of the ORF on the genome between PxGV and four NPV (Nuclear Polyhedrosis Virus) indicated that 19 PxGV ORF located to 48.5 to 83.4 m.u. showed a very similar alignment. Four highly conserved homologous regions consisting of a repeat sequence were found.
Plutella xylostella Granulovirus(PxGV)の全ヌクレオチド配列の決定をおこなった。PxGVゲノムの大きさは、100,999bp(base pair)であった。50アミノ酸鎖長以上のORF(開放読み取り枠)は120個見つかった。これらのORFのうち、57個は5種のバキュロウイルスに共通であった。PxGVと4種のNPV(核多角体ウイルス)のゲノム上のORFについての遺伝子パリティプロット解析をおこなったところ、48.5m.u.から83.4m.u.に位置している19個のPxGVORFが、他のウイルスと非常に類似した配置をしていた。反復配列から成る保存度の高い相同領域が4箇所見つかった。 |
| キーワード | PxGV; Plutella xylostella granulovirus; virus genome; ORF; amino acid; baculovirus; gene parity plot analysis; NPV; repeat sequence; open reading frame; nuclear polyhedrosis virus; PxGV; Plutella xylostella granulovirus; ウイルスゲノム; ORF; アミノ酸; バキュロウイルス; 遺伝子パリティプロット解析; NPV; 反復配列; 開放読み取り枠; 核多角体ウイルス |
| 資料種別 | Technical Report |
| ISSN | 0919-3405 |
| SHI-NO | AA0001808006 |
| URI | https://repository.exst.jaxa.jp/dspace/handle/a-is/56206 |
