| タイトル | Development of statistical mechanical method for predicting protein secondary structures |
| その他のタイトル | 蛋白質の2次構造を予測する統計力学的方法の開発 |
| 著者（日） | 小林 幸夫 |
| 著者（英） | Kobayashi, Yukio |
| 著者所属（日） | 理化学研究所 |
| 著者所属（英） | Institute of Physical and Chemical Research |
| 発行日 | 1995 |
| 発行機関など | Institute of Physical and Chemical Research
理化学研究所 |
| 刊行物名 | High Performance Computing in RIKEN, 1995
High Performance Computing in RIKEN, 1995 |
| 巻 | Vol.1 |
| 開始ページ | 221 |
| 終了ページ | 223 |
| 刊行年月日 | 1995 |
| 言語 | eng |
| 抄録 | A statistical mechanical method which predicts secondary structure of proteins was proposed to develop a method to determine their tertiary structure automatically. Parameters were optimized referring to 80 proteins which lack homology among them. Prediction accuracy was estimated for 13 proteins. Resulted values fall in between 54 and 90 percent. It was found that the predictive accuracy of this method was not remarkably high compared with those of other methods.
蛋白質の3次構造を自動的に予測する方法を開発するために、それの2次構造を予測する統計力学的な方法を提示した。パラメータは、それらの内に相同のない80種の蛋白質を参照にして最適化した。13種の蛋白質について2次構造を予測し、それらの精度を求めた。結果は54-90%の値をとり、この方法の予測精度が他の方法に比較し顕著に高くないことが明らかになった。 |
| キーワード | simulation; statistical mechanical method; protein; secondary structure; tertiary structure; prediction; alpha helix; beta strand; coil; predictive accuracy; シミュレーション; 統計力学的方法; 蛋白質; 2次構造; 3次構造; 予測; αヘリックス; βストランド; コイル; 予測精度 |
| 資料種別 | Technical Report |
| ISSN | 1342-3428 |
| SHI-NO | AA0000561064 |
| URI | https://repository.exst.jaxa.jp/dspace/handle/a-is/57242 |
